Assas Recherche | Isolement, identification et caractérisation fonctionnelle de nouveaux microorganismes d’intérêt pour la nutrition et la santé intestinale : cas d’étude sur les bactéries fibrolytiques du cheval

Isolement, identification et caractérisation fonctionnelle de nouveaux microorganismes d’intérêt pour la nutrition et la santé intestinale : cas d’étude sur les bactéries fibrolytiques du cheval (Document en Français)

Accès au(x) document(s)

Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.

Modalités de diffusion de la thèse :

Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2031.
Thèse soumise à l'embargo de l'auteur : embargo illimité (communication intranet).

Informations sur les contributeurs

Auteur : Froidurot (Froidurot), Alicia

Froidurot (Froidurot), Alicia

Nom

Froidurot

Nom de naissance

Froidurot

Prénom

Alicia

Nationalité

Français

Date de soutenance : 09-12-2021

Directeur(s) de thèse : Julliand Ve?ronique

Julliand, Ve?ronique

Nom

Julliand

Prénom

Ve?ronique

Etablissement de soutenance : Bourgogne Franche-Comté

Bourgogne Franche-Comté

Nom

Bourgogne Franche-Comté

Laboratoire : Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM) (Dijon)

Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM) (Dijon)

Nom

Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM) (Dijon)

Ecole doctorale : École doctorale Environnements, Santé (Dijon ; Besançon ; 2012-....)

École doctorale Environnements, Santé (Dijon ; Besançon ; 2012-....)

Nom

École doctorale Environnements, Santé (Dijon ; Besançon ; 2012-....)

Informations générales

Discipline : Biologie des populations et écologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Bactéries cellulolytiques, Eos, F. succinogenes, R. flavefaciens, Microbiote intestinal, Probiotiques
Mots-clés :

Flore intestinale
Foin
Maladies équines
Probiotiques
Acides gras
Bactéries

Résumé : Malgré leur faible quantité, les bactéries cellulolytiques jouent un rôle très important dans l’équilibre du microbiote intestinal et donc dans la nutrition et la santé du cheval par la valorisation des fibres issues des fourrages. Certains facteurs de conduite sont responsables de la diminution du nombre de bactéries cellulolytiques, conduisant à des déséquilibres du microbiote et à l’apparition de maladies intestinales. La possibilité d’utiliser les bactéries cellulolytiques comme probiotiques de nouvelle génération a été investiguée afin de les réintroduire dans le microbiote intestinal lors d’un déséquilibre. Les objectifs de ce travail de thèse étaient d’isoler de nouvelles souches cellulolytiques équines, de caractériser leurs fonctionnalités et d’évaluer leur production et conservation à grande échelle. Deux nouvelles souches ont été isolées, Fibrobacter succinogenes HC4 et Ruminococcus flavefaciens VN. Elles sont extrêmement sensibles à l’oxygène (EOS pour « extremely oxygen sensitive »). La recherche des gènes codant pour les CAZymes impliquées dans la fibrolyse et la quantification de cette activité par dosage enzymatique ont été investiguées. Les nouvelles souches ont montré de grandes capacités cellulolytique et xylanolytique. F. succinogenes HC4 est une bactérie spécialisée dans la dégradation de la cellulose alors que R. flavefaciens VN a des fonctions plus diversifiées avec notamment une activité xylanolytique très importante. L’activité fibrolytique de F. succinogenes HC4 a été étudiée in vitro dans l’écosystème fécal de chevaux préalablement soumis à un stress alimentaire induisant un déséquilibre du microbiote. L’ajout de F. succinogenes HC4 a été associé à une augmentation significative de la production en gaz et des concentrations en acides gras volatils au cours des 48 premières heures de mise en culture, en cohérence avec la diminution plus rapide de la matière sèche résiduelle du foin. Afin de produire la souche H C4 en plus grande quantité, la croissance de F. succinogenes HC4 a été obtenue dans un bioréacteur 0,5 L en condition d’anaérobiose avec de la cellulose (papier filtre Whatman No. 1) comme seule source de carbone dans un premier essai. La conservation de la souche HC4 par lyophilisation a été testée. La souche a repris sa croissance, néanmoins, une perte de deux logarithmes décimaux de bactéries viables a été observée. La composition du milieu, les conditions de croissance et les paramètres à réguler dans le bioréacteur, ainsi que l’optimisation du procédé de lyophilisation sont nécessaires afin d’augmenter sa biomasse et sa survie lors du procédé de séchage pour des durées plus longues de conservation. Ensuite le potentiel probiotique de la souche HC4 pourrait être validé par des essais in vivo.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2021UBFCK050
Type de ressource : Thèse

Fiche descriptive