Assas Recherche | Modélisation de la dynamique des réseaux biologiques : applications en génétique et immunologie

Modélisation de la dynamique des réseaux biologiques : applications en génétique et immunologie (Document en Français)

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Version :

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Informations sur les contributeurs

Auteur : Hazgui Hana

Hazgui, Hana

Nom

Hazgui

Prénom

Hana

Nationalité

Date de soutenance : 11-12-2015

Directeur(s) de thèse : Demongeot Jacques

Demongeot, Jacques

Nom

Demongeot

Prénom

Jacques

Etablissement de soutenance : Université Grenoble Alpes (ComUE)

Université Grenoble Alpes (ComUE)

Nom

Université Grenoble Alpes (ComUE)

- Université de Sfax. Faculté des sciences

Université de Sfax. Faculté des sciences

Nom

Université de Sfax. Faculté des sciences

Laboratoire : Âge, imagerie, modélisation (Grenoble, Isère, France ; 2011-2014)

Âge, imagerie, modélisation (Grenoble, Isère, France ; 2011-2014)

Nom

Âge, imagerie, modélisation (Grenoble, Isère, France ; 2011-2014)

Ecole doctorale : École doctorale ingénierie pour la santé, la cognition, l'environnement (Grenoble ; 1995-....)

École doctorale ingénierie pour la santé, la cognition, l'environnement (Grenoble ; 1995-....)

Nom

École doctorale ingénierie pour la santé, la cognition, l'environnement (Grenoble ; 1995-....)

Informations générales

Discipline : Modèles, méthodes et algorithmes en biologie, santé et environnement
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Gène, Recombinaison, Modélisation, Tcr, Réseau
Mots-clés :

Information génétique - Modèles mathématiques
Immunologie - Modèles mathématiques

Résumé : Dans cette thèse, nous nous intéressons à la modélisation statistique de données biologiques, et plus particulièrement à l'étude de l'information génétique et protéique.Dans un premier volet, nous avons amélioré un modèle statistique des données immunologiques existant chez la souris, que nous avons transposé à l'homme, afin d'étudier les différentes recombinaisons qui apparaissent au sein du thymus, à la fin de la vie embryonnaire, entre les segments des gènes de la portion V(D)J du chromosome 14 humain, appelées recombinaisons V(D)J.Dans un deuxième volet, nous avons étudié l'information génétique par le biais des réseaux de régulations génétique, celui de la maladie familiale « atrésie biliaire », ainsi que dans les réseaux de contrôle du système immunitaire, que nous avons appelés « Immunetworks ».Dans un troisième volet, nous proposons une nouvelle approche de la compression des données biologiques, qui intègre une étape de modélisation des processus dynamiques qui leur ont donné naissance : nous avons appelé cette approche la transformée Dynalet et nous l'appliquons, entre autres, à des signaux de spectrométrie RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) des protéines et acides nucléiques. Cette méthode consiste à convertir les signaux de spectrométrie en sons, afin de construire une lutherie anharmonique permettant de reproduire les pics de relaxation périodisés, issus des spectres RMN des 20 acides aminés, ainsi que de ceux des 4 bases nucléiques azotées.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2015GREAS040
Type de ressource : Thèse

Fiche descriptive