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Étude de l'occurence de Burkholderia pseudomallei dans la région Antilles-Guyane (Document en Français)

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Modalités de diffusion de la thèse :

Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 30/04/2025 (communication intranet).

Informations sur les contributeurs

Auteur : Gasqué Mégane

Gasqué, Mégane

Nom

Gasqué

Prénom

Mégane

Nationalité

Français

Date de soutenance : 19-06-2024

Directeur(s) de thèse : Rochelle-Newall Emma J.

Rochelle-Newall, Emma J.

Nom

Rochelle-Newall

Prénom

Emma J.

- Laroucau Karine

Laroucau, Karine

Nom

Laroucau

Prénom

Karine

- Guernier Vanina

Guernier, Vanina

Nom

Guernier

Prénom

Vanina

Etablissement de soutenance : Sorbonne université

Sorbonne université

Nom

Sorbonne université

Laboratoire : Institut d’écologie et des sciences de l’environnement de Paris (1997-....)

Institut d’écologie et des sciences de l’environnement de Paris (1997-....)

Nom

Institut d’écologie et des sciences de l’environnement de Paris (1997-....)

Ecole doctorale : École doctorale Sciences de l'environnement d'Île-de-France (Paris ; 1992-....)

École doctorale Sciences de l'environnement d'Île-de-France (Paris ; 1992-....)

Nom

École doctorale Sciences de l'environnement d'Île-de-France (Paris ; 1992-....)

Informations générales

Discipline : Sciences du climat, de l'atmosphère et des océans, terrestres et planétaire
Classification : Médecine et santé, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Burkholderia peudomallei, OneHealth, Environnement, Génomique, Bacille de Whitmore
Mots-clés :

Burkholderia pseudomallei
Mélioïdose - Antilles françaises
Mélioïdose - Guyane
Génomique

Résumé : Burkholderia pseudomallei est l'agent pathogène responsable de la mélioïdose, une infection opportuniste. Elle est endémique en Asie du Sud, en Asie du Sud-Est et dans le Nord de l'Australie. En 2015, le nombre de cas annuels de mélioïdose était estimé à 165 000 dans le monde. Cette bactérie a la capacité d'infecter l'homme et les animaux par inhalation, ingestion ou contact cutané. Depuis plusieurs années, des cas humains de mélioïdose sont signalés en dehors des zones endémiques connues, notamment dans la région Antilles-Guyane. Depuis 1993, vingt cas humains de mélioïdose ont été recensés en Martinique et cinq en Guadeloupe. Des enquêtes épidémiologiques ont révélé que de nombreux patients n'avaient jamais voyagé dans des zones endémiques, suggérant une contamination locale. L'objectif de cette thèse était de confirmer l'implantation locale de B. pseudomallei dans la région Antilles-Guyane, en utilisant une approche « Une seule santé » qui étudie l'homme, l'animal et l'environnement. À cette fin, une collecte exhaustive des cas humains a été réalisée, accompagnée d'enquêtes sérologiques chez les animaux et d'enquêtes environnementales. En parallèle, un outil de typage moléculaire a été développé pour prédire la provenance géographique des souches isolées.Une revue de la littérature et des entretiens avec les cliniciens ont été menés pour recenser les cas humains. Les analyses sérologiques ont été effectuées à l'aide d'un kit ELISA-GLANDA. Deux types d'enquêtes environnementales ont été menées : des enquêtes ciblées dans les élevages présentant des animaux séropositifs et des enquêtes aléatoires en Guadeloupe et aux Saintes.Le recensement des cas humains a permis d'identifier vingt cas publiés dans la littérature, auxquels s'ajoutent cinq cas supplémentaires suite à des entretiens avec les cliniciens. L'enquête sérologique a révélé la présence d'animaux séropositifs sur tous les territoires, suggérant une présence locale de la bactérie, avec des taux de séroprévalence plus élevés chez les équins (24%) et les bovins (16%) en Guyane, chez les équins (9%) en Martinique et chez les caprins (39%) aux Saintes. Les enquêtes environnementales ciblées dans les élevages aux Saintes ont permis d'isoler une souche de B. pseudomallei, tandis que les enquêtes aléatoires en Guadeloupe et aux Saintes ont révélé des sols positifs en PCR, confirmant ainsi la présence locale de la bactérie.Cette thèse représente la première étude de ce type réalisée dans la région Antilles-Guyane. La mise en place d'une approche « Une seule santé » a permis d'obtenir des données préliminaires sur la présence de B. pseudomallei dans cette région. Ce projet constitue une première étape vers d'autres initiatives. Pour confirmer la présence de B. pseudomallei en Martinique et en Guyane, il est nécessaire de mener des enquêtes environnementales dans les élevages où des animaux séropositifs ont été identifiés. De plus, de nouvelles recherches pourraient être entreprises en Guadeloupe pour caractériser les types de sols où la présence de B. pseudomallei a été détectée, enrichissant ainsi la littérature scientifique. Cette étude souligne la possibilité d'appliquer une approche interdisciplinaire basé sur concept « Une seule santé » pour mieux comprendre la répartition d'autres bactéries environnementales pathogènes.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2024SORUS169
Type de ressource : Thèse