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Aerotaxis and the collective spreading of social and asocial amoebae (Document en Anglais)

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Modalités de diffusion de la thèse :

Thèse consultable sur internet, en texte intégral.

Informations sur les contributeurs

Auteur : Ghazi Nasser

Ghazi, Nasser

Nom

Ghazi

Prénom

Nasser

Nationalité

Français

Date de soutenance : 19-12-2024

Directeur(s) de thèse : Rieu Jean-Paul

Rieu, Jean-Paul

Nom

Rieu

Prénom

Jean-Paul

- Anjard Christophe

Anjard, Christophe

Nom

Anjard

Prénom

Christophe

Etablissement de soutenance : Lyon 1

Lyon 1

Nom

Lyon 1

Laboratoire : Institut Lumière Matière

Institut Lumière Matière

Nom

Institut Lumière Matière

Ecole doctorale : École doctorale de Physique et Astrophysique de Lyon (Lyon ; 1991-....)

École doctorale de Physique et Astrophysique de Lyon (Lyon ; 1991-....)

Nom

École doctorale de Physique et Astrophysique de Lyon (Lyon ; 1991-....)

Informations générales

Discipline : Physique
Classification : Physique

Mots-clés libres : Cellules, Oxygène, Hypoxique, Dynamiques, Aerotaxis, Densité
Mots-clés :

Dictyostelium discoideum
Équations de réaction-diffusion
Amibes
Diffusion (physique)

Résumé : Cette thèse étudie les mécanismes de l'aérotaxie—le mouvement dirigé en réponse aux gradients d'oxygène—chez l'amibe sociale Dictyostelium discoideum (Dd) et l'amibe asociale Acanthamoeba castellanii (Ac). En combinant des observations expérimentales avec la modélisation réactiondiffusion (RD), nous explorons comment ces organismes réagissent à l'hypoxie et comment leurs comportements collectifs émergent. En commençant par Dd, nous développons davantage le flux aérotactique en utilisant des données expérimentales et l'intégrons dans un modèle RD qui simule avec succès la formation et la propagation d'anneaux cellulaires observés dans des essais spot confinés en raison de gradients d'oxygène auto-générés. Une analyse systématique des paramètres du modèle RD révèle leurs influences respectives sur la propagation aérotactique collective. En étendant notre étude de l'aérotaxie à Ac, nous constatons qu'une densité cellulaire accrue chez Ac conduit à une diminution de la motilité en raison d'effets induits par les collisions, que nous modélisons en utilisant la théorie du libre parcours moyen. Dans les essais de confinement, les cellules d'Ac affichent également une propagation aérotactique collective entraînée par des gradients d'oxygène auto-générés ; à haute densité, une bande dissipative et des cellules leaders émergent, et à faible densité, des cellules se déplaçant de manière balistique s'éloignent de la colonie initiale. En incorporant dans le modèle RD des coefficients de diffusion et des potentiels aérotactiques dépendant de la densité, obtenus expérimentalement, nous simulons avec précision ces comportements observés.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2024LYO10368
Type de ressource : Thèse