Assas Recherche | Développement de nouvelles approches pour l’analyses des interactions cellulaires dans les maladies immunitaires

Développement de nouvelles approches pour l’analyses des interactions cellulaires dans les maladies immunitaires (Document en Français)

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Modalités de diffusion de la thèse :

Thèse consultable sur internet, en texte intégral.

Informations sur les contributeurs

Auteur : Laurent Thomas

Laurent, Thomas

Nom

Laurent

Prénom

Thomas

Nationalité

Français

Date de soutenance : 06-04-2023

Directeur(s) de thèse : Josien Régis

Josien, Régis

Nom

Josien

Prénom

Régis

- Martin Jérôme

Martin, Jérôme

Nom

Martin

Prénom

Jérôme

- Poschmann Jérémie

Poschmann, Jérémie

Nom

Poschmann

Prénom

Jérémie

Etablissement de soutenance : Nantes Université

Nantes Université

Nom

Nantes Université

Laboratoire : @Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

@Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

Nom

@Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

Ecole doctorale : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

Nom

École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

Informations générales

Discipline : Biologie, médecine et santé
Classification : Médecine et santé

Mots-clés libres : Single cell RNAseq, Bioinformatique, Greffe de rein, Maladie de Crohn
Mots-clés :

Immunologie de transplantation
Rein -- Transplantation

Résumé : Le développement des technologies de séquençage a ouvert la voie vers la caractérisation des mécanismes immunopathologiques en atteignant la précision des cellules uniques. L’application de ce type d’analyses transcriptomiques à des échantillons de cellules circulantes provenant de receveur de greffe de rein nous a permis de suivre de manière longitudinale les dynamiques post transplantation des différentes populations immunitaires. Nous avons mis en avant l’émergence d’une signature d’activation précoce préférentiellement exprimée par les cellules immunitaires des patients qui subissent un rejet de greffe par la suite. Cette signature semble indiquer un recrutement favorisé de lymphocytes T et monocytes via l’axe CXCR4- CXCL12 qui participerait à la détérioration des tissus menant au rejet. Dans le second projet, l’application du séquençage en cellule unique a permis d’étudier les programmes moléculaires en jeu au sein des tissus d’iléons de patients atteints de la maladie de Crohn. Par l’adaptation de l’algorithme de Metacell combinée à une analyse de modules de gènes sur notre jeu de données, il a été possible d’identifier avec précision une hétérogénéité de profils au sein des macrophages avec la présence de signatures inflammatoires et pro-fibrotiques enrichies chez les patients ne répondant pas au traitement clinique d’anti-TNFa actuel. Ces résultats proposent de nouvelles pistes de compréhension pour expliquer les différences de réponses de patients et permettent d’envisager de nouveaux traitements plus adaptées pour cibler les programmes moléculaires actives chez les patients non répondeurs.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2023NANU1017
Type de ressource : Thèse