Assas Recherche | Étude épigénétique et transcriptomique de la réponse immunitaire innée à la suite de pneumonie acquise à l’hôpital ou lors du rejet de greffe.

Étude épigénétique et transcriptomique de la réponse immunitaire innée à la suite de pneumonie acquise à l’hôpital ou lors du rejet de greffe. (Document en Français)

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Modalités de diffusion de la thèse :

Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 23/03/2025 (communication intranet).

Informations sur les contributeurs

Auteur : Molle? Alice

Molle?, Alice

Nom

Molle?

Prénom

Alice

Nationalité

Français

Date de soutenance : 23-03-2022

Directeur(s) de thèse : Josien Régis

Josien, Régis

Nom

Josien

Prénom

Régis

- Poschmann Jérémie

Poschmann, Jérémie

Nom

Poschmann

Prénom

Jérémie

Etablissement de soutenance : Nantes Université

Nantes Université

Nom

Nantes Université

Laboratoire : @Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

@Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

Nom

@Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

Ecole doctorale : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

Nom

École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

Informations générales

Discipline : Génétique moléculaire
Classification : Médecine et santé

Mots-clés libres : ChIP-seq H3K27ac, ATAC-seq, RNA-seq
Mots-clés :

Transplantation (chirurgie)
Rejet de greffe
Immunosuppression

Résumé : Les nouvelles technologies de séquençage permettent de décoder les mécanismes immunologiques via leur expression génique (RNA-seq) qui est déterminée par la liaison de protéines à l'ADN (ChIP-seq) et à l'accessibilité de l’ADN (ATACseq). Lors de cette thèse, nous avons utilisé ces approches omiques dans deux types d'inflammation pour améliorer notre compréhension de ces maladies et de leur traitement. Une restauration excessive de l'homéostasie suite à une inflammation telle qu'une pneumonie peut entraîner une paralysie et une sensibilité accrue à une pneumonie secondaire. Nous avons dans un premier temps montré que l’immunosuppression induite par une lésion cérébrale expose les patients à une réactivation du virus de l’herpès simplex (HSV). Puis nous avons exploré les propriétés fonctionnelles des macrophages alvéolaires résidents avant, pendant et après la résolution de l’inflammation dans un modèle de pneumonie chez la souris, ainsi qu’une population de monocytes inflammatoires recrutés dans le tissu pulmonaire infecté. De plus, l'activation du système immunitaire inné à la suite d'une transplantation d'organe peut mener à une inflammation qui favorise le rejet. Dans un deuxième temps, nous avons étudié le rejet chronique en vérifiant la possibilité de détecter les modifications H3K27ac liées au rejet à l’aide d’un modèle d’allogreffe chez le rongeur. Puis nous avons évalué l’utilisation de cellules mononuclées du sang périphérique (PBMC) dans des cohortes de patients transplantés rénaux pour obtenir une vue d’ensemble du rejet chronique et cartographier les altérations transcriptomiques et épigénétiques survenant pendant le rejet.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2022NANU1045
Type de ressource : Thèse