Assas Recherche | Etudes structurales des polyomavirus BK et JC en interaction avec leurs récepteurs

Etudes structurales des polyomavirus BK et JC en interaction avec leurs récepteurs (Document en Anglais)

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Modalités de diffusion de la thèse :

Thèse consultable sur internet, en texte intégral.

Informations sur les contributeurs

Auteur : Sorin Marie

Sorin, Marie

Nom

Sorin

Prénom

Marie

Nationalité

Français

Date de soutenance : 15-09-2022

Directeur(s) de thèse : Mcilroy Dorian

Mcilroy, Dorian

Nom

Mcilroy

Prénom

Dorian

- Stehle Thilo

Stehle, Thilo

Nom

Stehle

Prénom

Thilo

Etablissement de soutenance : Nantes Université

Nantes Université

Nom

Nantes Université

- Eberhard-Karls-Universität (Tübingen, Allemagne)

Eberhard-Karls-Universität (Tübingen, Allemagne)

Nom

Eberhard-Karls-Universität (Tübingen, Allemagne)

Laboratoire : @Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

@Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

Nom

@Center for Research in Transplantation and Translational Immunology

Ecole doctorale : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

Nom

École doctorale Biologie-Santé (Nantes)

Informations générales

Discipline : Biologie, médecine et santé
Classification : Médecine et santé

Mots-clés libres : Polyomavirus, Interactions entre virus, BKPyV
Mots-clés :

Virus à ADN
Rein -- Transplantation

Résumé : Les polyomavirus BK et JC sont des virus à ADN double brin circulaire dont la capside en forme d'icosaèdre est composée de pentamères de la protéine VP1. Ces virus opportunistes peuvent se réactiver dans des contextes d'immunosuppression et peuvent causer principalement, pour le BKPyV, des néphropathies chez les greffés du rein, et, pour JCPyV, la leuco-encéphalopathie multifocale progressive. Cette thèse a pour but d'étudier les interactions entre ces virus et leurs récepteurs. Le premier projet a pour but de comprendre comment les mutations dans la protéine VP1 du BKPyV, fréquemment observées chez des greffés du rein, influencent le tropisme et la structure du virus. Grâce à des études fonctionnelles et structurales, nous avons pu mettre en évidence deux fonctionnements différents pour deux variants. Le variant N-Q a perdu sa capacité à se fixer aux gangliosides à cause de la mutation de l'acide aminé 69, suggérant que ce variant utilise un autre récepteur pour infecter les cellules 293TT. En revanche, le variant VQQ a un changement de conformation au niveau de la boucle BC et des acides aminés 72 et 73 et, malgré sa capacité à fixer de nombreux gangliosides, ce variant n'est presque pas capable d'infecter les cellules 293TT. Ceci suggère donc que VQQ n'interagit pas avec le récepteur inconnu ciblé par le variant N-Q. De plus, malgré sa fixation à de nombreux gangliosides, le variant VQQ ne semble pas pouvoir infecter efficacement les cellules LNCaP ou GM95 supplémentées. Le deuxième projet de cette thèse a pour but d'étudier le tropisme et la structure des différents génotypes du BKPyV. Les études fonctionnelles ont permis de montrer que les génotypes I, II et Ill étaient assez dépendent des acides sialiques pour l'infection alors que le génotype IV maintient une capacité d'infection de 50% malgré l'absence d'acide sialiques, indiquant donc qu'un autre récepteur semble être utilisé pour l'infection. La structure du pentamère de VP1 du glV ne révèle aucun changement majeur dans sa conformation comparé au gl. Enfin, le troisième projet se focalise sur la caractérisation de l'interaction entre le JCPyV et un de ses récepteurs d'entrée : le récepteur de la sérotonine 5HT2RB. Les pentamères de VP1 et des VLPs du JCPyV ont été purifiés ainsi que le récepteur 5HT2RB. L'objectif a ensuite été de faire du SPR afin de tester si le virus interagissait avec le récepteur via un pentamère uniquement ou à l'interface de multiples pentamères Cependant, les résultats n'ont pas été concluants.

Informations techniques

Type de contenu : Text
Format : PDF

Informations complémentaires

Entrepôt d'origine :

STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises

Identifiant : 2022NANU1017
Type de ressource : Thèse